Для коректной работы сайта необходимы разрешить выполнение сценариев javascript

190

Технические характеристики Прототип РСК Торнадо МФТИ

Технические характеристики Прототип РСК Торнадо МФТИ

  • Производительность: 
    2,5 ТФЛОПС (Peak) / 2,07 ТФЛОПС (LINPACK)
  • Узлов/Ядер (про-/сопроцессоров) /Потоков (про-/сопроцессоров): 
    16 / 192 / 384
  • Процессор: 
    32 x Intel® Xeon® X5680 (6 ядер, 3,33 ГГц)
  • Сопроцессор: 
    Не используются
  • Серверная плата: 
    Supermicro X8DTT
  • Общий объем памяти на узлах: 
    0,5 ТБ (DDR3-1600, low voltage green memory)
  • Общий объем системы хранения на узлах: 
    1 ТБ, твердотельные накопители Intel® SSD
  • Межузловое соединение: 
    InfiniBand QDR, 40 Гбит/c
  • Сервисная сеть: 
    2 независимые сети 1 GigE – сенсорная и управляющая
  • Занимаемая площадь: 
    0.64 м.кв.

Группа компаний РСК в рамках контракта с МФТИ разработала и установила пилотную систему, которая стала основой инновационного вычислительного кластера, используемого для проведения исследований в рамках работы в лаборатории суперкомпьютерных технологий для биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур I-SCALARE (Intel super computer applications laboratory for advanced research), созданной в рамках гранта Правительства России на базе Московского физико-технического института.

Новый суперкомпьютер МФТИ основан на инновационной архитектуре «РСК Торнадо» – это первое в мире энергоэффективное суперкомпьютерное решение с передовым жидкостным охлаждением для массово доступных стандартных серверных плат на базе процессоров Intel® Xeon®, изначально создававшихся для традиционных систем с воздушным обдувом электронных компонент. Архитектура «РСК Торнадо» обеспечивает гибкость конфигурации вычислительных узлов со стандартными интерфейсами и простоту построения решения, высокую ремонтопригодность (простота замены модулей оперативной памяти и увеличения ее объема, обновление на новые модели процессоров), возможность интеграции с любыми внешними изделиями со стандартными интерфейсами (PCI Express).

Пилотная кластерная система в МФТИ обладала производительностью в 2,5 TFLOPS (триллионов операций в секунду) и состояла из 16 вычислительных узлов, каждый из которых содержал по два наиболее высокопроизводительных на тот момент процессора Intel® Xeon® 5680 с тактовой частотой 3,33 ГГц. При этом в ней имелось 36 ГБ оперативной памяти на один узел, система хранения данных емкостью 3 ТБ, а коммуникационная сеть построена на базе высокоскоростного интерфейса Infiniband QDR. Уже в рамках пилотной системы вычислительный кластер обладал следующими уникальными характеристиками:

  • Простота и высокая надежность;
  • Экономическая эффективность;
  • Высокая энергоэффективность – рекордный показатель эффективности использования электроэнергии (PUE) менее 1,2, то есть не более 20% энергопотребления будет расходоваться на охлаждение;
  • Компактность и высокая плотность;
  • Большой коэффициент вычислительной эффективности – более 90% на тесте LINPACK;
  • Высокая масштабируемость;
  • Возможность использования ускорителей (архитектуры Intel MIC).

«Нам очень приятно, что передовые в мире инновационные российские технологии в области создания суперкомпьютерных решений, разработанные специалистами РСК, будут использоваться для развития новых отраслей знаний и достижений в отечественной науке, – отметил Александр Московский, генеральный директор компании «РСК Технологии». –  Поэтому мы придаем особое значение перспективам развития проекта в МФТИ по созданию энергоэффективного вычислительного кластера в лаборатории суперкомпьютерных технологий для биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур I-SCALARE».

Биоинформатика и моделирование лекарственных препаратов являются одними из самых быстрорастущих областей, где существует острая необходимость использования высокопроизводительных вычислений на суперкомпьютерах. Актуальность данного проекта состоит в том, что прорывы в сфере новых методов медицинской диагностики, лечения, создания новых лекарств и т.д. возможны только с развитием новых вычислительных моделей и платформ, учитывающих специфику био-медико-фармацевтических задач.

Информация о проекте

Московский физико-технический институт, лаборатория I-SCALARE

Главным из направлений деятельности лаборатории I-SCALARE в МФТИ является разработка проблемно-ориентированных архитектур вычислительных систем для задач биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур. В качестве «целевых» были выбраны несколько прикладных вычислительных задач, связанных с моделированием вирусов, клеточных  мембран, а также взаимодействия белков и внешних полей с клеточными мембранами. Все они, с одной стороны, имеют большую практическую ценность, а с другой – не могут быть решены на имеющихся вычислительных ресурсах и требуют новых подходов к архитектуре кластеров.

Даты выполнения проекта:
декабрь 2010 - декабрь 2010
Место выполнения:
Московская область, г. Долгопрудный, Россия