Группа компаний РСК в рамках контракта с МФТИ разработала и установила пилотную систему, которая стала основой инновационного вычислительного кластера, используемого для проведения исследований в рамках работы в лаборатории суперкомпьютерных технологий для биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур I-SCALARE (Intel super computer applications laboratory for advanced research), созданной в рамках гранта Правительства России на базе Московского физико-технического института.

Новый суперкомпьютер МФТИ основан на инновационной архитектуре «РСК Торнадо» – это первое в мире энергоэффективное суперкомпьютерное решение с передовым жидкостным охлаждением для массово доступных стандартных серверных плат на базе процессоров Intel® Xeon®, изначально создававшихся для традиционных систем с воздушным обдувом электронных компонент. Архитектура «РСК Торнадо» обеспечивает гибкость конфигурации вычислительных узлов со стандартными интерфейсами и простоту построения решения, высокую ремонтопригодность (простота замены модулей оперативной памяти и увеличения ее объема, обновление на новые модели процессоров), возможность интеграции с любыми внешними изделиями со стандартными интерфейсами (PCI Express).

Пилотная кластерная система в МФТИ обладала производительностью в 2,5 TFLOPS (триллионов операций в секунду) и состояла из 16 вычислительных узлов, каждый из которых содержал по два наиболее высокопроизводительных на тот момент процессора Intel® Xeon® 5680 с тактовой частотой 3,33 ГГц. При этом в ней имелось 36 ГБ оперативной памяти на один узел, система хранения данных емкостью 3 ТБ, а коммуникационная сеть построена на базе высокоскоростного интерфейса Infiniband QDR. Уже в рамках пилотной системы вычислительный кластер обладал следующими уникальными характеристиками:

• Простота и высокая надежность;
• Экономическая эффективность;
• Высокая энергоэффективность – рекордный показатель эффективности использования электроэнергии (PUE) менее 1,2, то есть не более 20% энергопотребления будет расходоваться на охлаждение;
• Компактность и высокая плотность;
• Большой коэффициент вычислительной эффективности – более 90% на тесте LINPACK;
• Высокая масштабируемость;
• Возможность использования ускорителей (архитектуры Intel MIC).

«Нам очень приятно, что передовые в мире инновационные российские технологии в области создания суперкомпьютерных решений, разработанные специалистами РСК, будут использоваться для развития новых отраслей знаний и достижений в отечественной науке, – отметил Александр Московский, генеральный директор компании «РСК Технологии». –  Поэтому мы придаем особое значение перспективам развития проекта в МФТИ по созданию энергоэффективного вычислительного кластера в лаборатории суперкомпьютерных технологий для биомедицины, фармакологии и малоразмерных структур I-SCALARE».

Биоинформатика и моделирование лекарственных препаратов являются одними из самых быстрорастущих областей, где существует острая необходимость использования высокопроизводительных вычислений на суперкомпьютерах. Актуальность данного проекта состоит в том, что прорывы в сфере новых методов медицинской диагностики, лечения, создания новых лекарств и т.д. возможны только с развитием новых вычислительных моделей и платформ, учитывающих специфику био-медико-фармацевтических задач.